Table des matières
- 1 Analyse de la recherche bibliographique
- 2 Microscopie non-linéaire : étude de nouvelles sondes fluorescentes
- 3 Conclusion
1 Analyse de la recherche bibliographique
1.1 Méthodologie
1.1.1 Identification des mots clés
En recherchant ces premiers mots-clés dans les bases de données, il n'a pas été très long de reconnaître les termes utilisés pour décrire les marqueurs fluorescents et l'ingénierie tournant autour.
1.1.2 Mots clés utilisés
keywords : Two-photon, fluorescence, non-linear microscopy, two-photon microscopy, multiphoton fluorescence, two-photon probes, fluorophore, absorption cross section, in-vivo imaging.1.1.3 Analyses des résultats pour les principaux mots-clés
Fig. 1 : Nombre de publications recencées par année pour le mot-clé Two-Photon 1.1.4 Justification du choix des sources
Même si seule une lecture et une analyse du contenu d'une publication peuvent permettre de juger de la pertinance des travaux présentés pour la réalisation d'une biblographie, la popularité de la publication peut donner une premier renseigement sur sa qualité.
Par exemple, pour l'article de W. Webb de 1990 paru dans Science, on relève un total de 995 citations dans les travaux d'autres chercheurs, tous journaux confondus, ce qui s'approche des 3/4 des publications parues. On peut donc penser que cet article ainsi que ses auteurs font référence dans le domaine.
C'est de cette manière que nous procèderons notamment pour déterminer quels seront les acteurs incontournables en microscopie non-linéaire.
1.2 Problèmes rencontrés
C'est donc pour cela que l'étude se dirige essentiellement sur les marqueurs fluorescents.
2 Microscopie non-linéaire : étude de nouvelles sondes fluorescentes
2.1 Historique
2.1.1 Dates importantes
[][][]Il a fallut ensuite attendre jusqu'en 1990 pour que Winfried Denk, encadré par Watt W. Webb, conçoive le premier microscope à deux photons, signant ainsi le début officiel de la recherche mondiale sur la microscopie à deux photons.
Dans les années qui ont suivies, et jusqu'à maintenant, la technique est globalement restée inchangée, en revanche, des applications se sont développées, notamment en terme d'imagerie intravitale.
Les études réalisées actuellement portent sur l'optimisation des marqueur fluorescents à deux photons qui jusqu'en 2003 étaient majoritairement de nature moléculaire. Suite à cette date, de nouveaux marqueurs à base de nano-cristallites ont commencé à voir le jour et, récemment (juin 2005) des nanoparticules d'or ont été utilisées pour l'imagerie intra-vitale.
2.1.2 Acteurs actuels
Bien qu'ils aient collaboré avec énormément de chercheurs, ont retrouve principalement à leurs côtés deux personnes , Karel Svoboda des laboratoires Bell et Fritjof Helmchen du Max Planck Institut.
Les travaux de Serge Charpak de l'ESPCI (Paris; France) ainsi que de Jérôme Mertz actuellement au département d'ingénierie biomédicale de l'université de Boston sont également de très bonnes références.
2.2 Microscopie de fluorescence par excitation des transitions d'absorption à deux photons
Matèriellement, elle est basée sur le même principe que la microscopie de fluorescence classique (microscope confocal).
2.2.1 Fluorescence par excitation des transitions d'absorption à deux photons
La molécule va donc se trouver dans un état excité et va se désexciter en émettant un seul photon d'énergie deux fois supèrieur à celle des photons excitateurs. Ce processus peut se généraliser à une absorption multiple simultannée de plusieurs photons. La probabilité de transition de ces états est très faible en comparaison à l'absorption d'un photon unique, d'où la nécesité de disposer dun puissance laser suffisante (lasers de type Sa:Ti ou Nd:YAG pulsés) pour obtenir une très grande concentration volumique de photons.
De ce fait, la miroscopie non-linéaire va présenter un avantage majeur dans l'imagerie en trois dimensions des systèmes vivant : la fluorescence non linéaire n'ayant lieu qu'en un point localisé et dont la position dans le milieu sera contrôlable par une simple translation d'une lentille afin de modifier l'emplacement du point de focalisation autorise une excellente qualité de résolution pour une imagerie à trois dimensions.
2.2.2 Intérêt de l'utilisation de la fluorescence à deux photons en microscopie
Dans le cas de la fluorescence à un photon, le faisceau incident excitateur présentera des photons dont l'énergie sera suffisante pour faire passer toutes les molécules marquant le milieu à imager dans un état excité. Le faisceau étant rapidement diffusé, des marqueurs n'étant pas situé directement dans le champ d'investigation vont également se retrouver dans un état excité et ré-émettre de la lumière qui sera à son tour diffusée comme vont l'être les photons émis dans le bon volume d'imagerie.
La diffusion pose donc un réel problème car malgré des techniques optiques pour limiter spatialement le faisceau de retour, il n'est pas évident de pouvoir effectuer un tri entre les photons ballistiques (non diffusés) et les photons diffusés.
Dans le cas de l'utilisation de marqueurs fluorescents à deux photons, l'absorption non linéaire ne se fera qu'au point focal d'un faiscau laser où la densité de photons sera suffisante pour exciter les transitions à deux photons. Une excitation à deux photons permettra également d'utiliser des sources dont les longueurs d'onde sont plus longues, donc moins diffusés (diffusion proportionnelle à 1/λ4).
2.2.3 Effets limitant la résolution en imagerie de fluorescence à deux photons : saturation, diffusion chimique et photoblanchiement
Lors de l'excitation des molécules, celles-ci sont originellement dans un état fondamentale d'énergie. Leur état excité va présenter une certaine durée de vie inversement proportionnelle à la probabilité de désexcitation de la molécule. En fonction de la durée de vie de cet état, la population de molécules dans l'état fondamentale va varier. Que ce soit par une excitation par un laser continu ou impulsionnel, cette durée devie va faire qu'à un moment, le niveau fondamental sera complètement dépeuplé : c'est la saturation de la transition. L'efficacité de fluorescence va alors diminuer car dépendant directement de la probabiltié de présence de molécules dans l'état fondamental.
Dans le cas de l'imagerie intra-vitale, comme la visualisation des vaisseaux capilaires dans le cerveau d'une souris, le volume d'excitation correspondant au volume focal du faisceau laser est bien plus faible que le volume contenant les marqueurs fluorescents. Il va donc en résulter que l'efficacité de fluorescence dans le volume total va dépendre de la concentration en molécules marqueurs ains que de leur capacité à diffuser dans le volume.
Le dernier effet limitant l'efficacité de fluorescence dépend quant à lui de la puissance du laser excitateur et du nombre de fois qu'un marqueur sera excité.
Dans le cas d'une molécule, l'absorption à deux photons et la ré-émission d'un photon sont liées à des réactions photochimiques. A force de réaliser ces réactions, les liaisons concernées par la photochimie vont se fragiliser puis céder. Le marqueur ne sera plus utilisable pour la fluorescence. C'est le photoblanchiement de la transition.
2.3 Marqueurs fluorescents par excitation de la transition d'absorption à deux photons
Tous les marqueurs fluorescents à un photon présentent des propriétés de fluorescence à deux photons. L'efficacité du processus de chaque marqueur va dépendre essentiellement de la section efficace d'absorption à deux photons. Pour l'imagerie microbiologique, on cherchera des marqueurs possédant une bonne section efficace d'absorption à deux photons ainsi que des qualités essentielles comme la non-toxicité ou la diffusibilité qui devra être adaptée à l'application étudiée (par exemple, le marquage de cellules uniques).
Il existe principalement deux techniques de marquage en imagerie de fluorescence : la marquage exogène et le marquage endogène.
Au cours de la partie qui va suivre, nous allons dresser un bref état de l'art concernant les marqueurs fluorescents à deux photons puis nous verrons quelles sont les dernières avancées en ingénierie des marqueurs.
2.3.1 Marqueurs exogènes
- Marqueurs moléculaires [] :
Les marqueurs moléculaires sont des molécules présentant généralement des cycles et qui selon les cas seront soit hydrosolubles soit organo-solubles.
En fonction des applications recherchées, on choisira différents types de molécules. Certaines auront la propriété de marquer le flot sanguin, d'autres pourront pénétrer le noyau des cellules ou marquer seulement leur cytoplasme.
Les marqueurs moléculaires sont soumis à tous les effets que nous avons décrit précédemment et représentent la plupart du travail de recherche qui a été effectué en microscopie de fluorescence à un et deus photons.
- Les nanocristalytes[] :
Les nanocristalytes sont des nano-cristaux semi-conducteurs présentant des propriétés de fluorescence à un et deux photons lors d'une excitation par lumière laser. Ces cristaux sont généralement toxiques mais peuvent être encapsulés dans une membrane, les rendant ainsi très hydrosolubles.
La fluorescence de ces cristaux est basée sur l'effet photoélectrique décrit par A. Einstein. Les photons absorbés vont d'abord créer une paire électron-trou en emmenant un électron situé dans la bande de valence du cristal vers sa bande de conduction. L'électron et le trou en se recombinant vont alors émettre un photon dont l'énergie sera égale à l'énergie de gap du cristal.
Ces cristaux possèdent une spectre d'excitation large pour des raies d'émission très fines. Leur section efficace d'absorption est de loin plus importante que celle des marqueurs moléculaires et sont plus résistant aux photoblanchiement des transitions.
2.3.2 Marqueurs endogènes
[]La nature même du marquage résout le problème de toxicité car directement inclus dans les gènes de l'animal.
2.3.3 Les nouveaux marqueurs fluorescents à deux photons
La solution à ce problème est de développer des marqueurs dont la section efficace d'absorption à deux photons est maximisée. C'est donc dans cette voie que les recherches actuelles sont orientés.
Nous allons maintenant présenter deux nouveaux marqueurs fluorescents spécifiquement étudiés pour optimiser la section efficace d'absorption à deux photons et dont les travaux ont été récemment publiés.
- Fluorescence par excitation à deux photons de la molécules GMO-4 [] :
En utilisant le fait qu'une molécule constituée d'une structure symétrique du type D-π-cycle aromatique-π-D (D = donneur,π= intercalant conjugué), un groupe constitué d'une collaboration entre chimistes et physiciens ont élaboré une molécule présentant une section efficace d'absorption à deux photons très largement supèrieure à celle des molécules courantes à une longueur d'onde d'excitation aux alentours de 530 nm. Cette molécule semble également présenter un autre maximum de sa section efficace dans une région du spectre lumineux comprise entre 650 nm et 700 nm, champ qui n'a pu être exploré dans son entier du fait de la limitation de leurs lasers excitateurs.
Le maximum de fluorescence de la molécule se situe dans le bleu à 450 nm, soit dans la même gamme que sa fluorescence par excitation à un photon.
- Fluorescence par excitation à deux photons de nano-baguettes d'or[] :
La fluorescence de particules de métaux nobles est un processus équivalent à la fluorescence des nanocristaux semi-conducteurs. Ce processus a été décrit comme présentant trois étapes. La première est l'absorption d'un photon faisant passer un électron de la bande de valence à la bande de conduction. La paire électron-trou ainsi créée va alors diffuser dans le matériau puis se recombiner en dispersant une partie de son énergie dans le réseau de phonons du matèriau (particules traduisant une vibration collective des atomes) et en émettant un photon. Il a été montré que ce processus,valable aussi bien à un qu'à deux photons, était d'autant plus efficace que le matériau était excité à sa fréquence plasma (résonnance des plasmons de surface).
Les nano-particules d'or étudiées ici présentent un maximum d'absorption à deux photons à la longueur d'onde correspondant à la fréquence plasma du matèriau soit à 820 nm. Sa fluorescence se fait sur une bande spectrale allant de 400 nm à 650 nm pour des absorptions à deux photons comprises entre 700 nm et 900 nm.
3 Conclusion
Au cours du document, nous avons pu voir que les études expérimentales sur ce domaine avaient débuté essentiellement à partir de 1990, même si la théorie de ces phénomènes a été établie il y a plus de 70 ans de cela avec une première démonstration expériementale de la fluorescence par excitation à deux photons dans les années 60.
Après avoir décrit les avantages et effets influant dans cette méthode, nous avons vu quels étaient les types de sondes fluorescentes mises en oeuvre en microscopie de fluorescence pour terminer sur deux découvertes récentes concernant les marqueurs spécifiques à la fluorescence à deux photons.
Comme l'ont montré les analyses sur les différents mots-clés et publications, les travaux portant sur les domaines de la microscopie de fluorescence par absorption à deux photons connaissent une croissance quasi-exponentielle avec les années.
L'apparition de nouvelles technologies liées à l'exploration du micro et nano-monde vont sans aucun doute contribuer prochainement à l'élaboration de nouvelles sondes aux propriétés directement dictées par des effets de la physique à ces échelles, offrant alors des marqueurs présentant des sections efficaces d'absorption à deux photons qui iront toujours en s'accroissant.
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